数据集概述
本数据集记录野生狒狒(Papio cynocephalus)的全基因组DNA甲基化水平,对比分析自然觅食与获取人类食物残渣的狒狒群体差异,识别出1014个差异甲基化位点,涉及代谢相关基因调控区域,为资源可获得性影响野生动物表观基因组提供证据,包含5个相关文件。
文件详解
- methylated_read_counts.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含甲基化读取计数相关数据的压缩文件
- cell_type_counts.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录样本(Sample)、是否属于Lodge组(Lodge_grp)、各类细胞(Basophil、Eosinophil、Neutrophil、Lymphocyte、Monocyte)数量及总数(Total)的计数数据
- counts_tables_columns.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:计数表格的列信息说明文件
- total_read_counts.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含总读取计数相关数据的压缩文件
- Lea_et_al_MACAU_output.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:MACAU分析输出结果文件,涉及差异甲基化位点等分析数据
适用场景
- 野生动物表观遗传学研究: 分析资源可获得性对野生狒狒DNA甲基化水平的影响机制
- 分子生态学研究: 探究生态因素与野生动物分子表型的关联
- 代谢相关基因调控研究: 基于差异甲基化位点分析代谢基因的表观遗传调控
- 野生动物适应性进化研究: 结合表观遗传数据研究野生动物对环境变化的适应策略