数据集概述
本数据集围绕翡翠珊瑚虾虎鱼(Paragobiodon xanthosoma)社会群体的遗传相关性展开研究,通过分析巴布亚新几内亚金贝湾3个珊瑚礁16个群体共73个个体的20个微卫星基因座基因型数据,探究其群体内及群体间的亲缘关系模式,为理解海洋鱼类社会演化中亲属选择的作用提供基础数据,包含5个相关文件。
文件详解
- Readme_RelatednessGobies_Ruegeretal-2021-MolEcol.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、数据采集与分析方法、文件清单及使用说明等内容
- Supplemental_Material_20201005.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:补充材料文档,可能包含研究方法细节、额外分析结果或图表说明等内容
- Rueger_et_al_Analysis.Rmd
- 文件格式:RMD
- 字段映射介绍:数据分析代码文件,包含用于计算遗传相关性、统计检验等分析步骤的R语言代码
- Rueger_et_al_2020_Pxanthosoma_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:原始数据文件,包含73个个体的微卫星基因型数据、群体归属信息等基础数据
- select_contrasts_20201005.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:对比分析结果文件,包含number(编号)、estimate(估计值)、SE(标准误)、df(自由度)、lower.CL(置信区间下限)、upper.CL(置信区间上限)、t.ratio(t值)、p.value(p值)、sig(显著性)、Group(分组)、Contrast(对比类型)等字段
数据来源
论文“Genetic relatedness in social groups of the emerald coral goby Paragobiodon xanthosoma creates potential for weak kin selection”
适用场景
- 海洋鱼类遗传结构研究:分析翡翠珊瑚虾虎鱼群体内及群体间的遗传相关性分布模式
- 亲属选择理论验证:探究亲属选择在海洋鱼类社会群体形成与演化中的作用
- 微卫星基因数据分析方法参考:学习基于微卫星标记的遗传相关性计算与统计检验流程
- 鱼类社会行为演化机制研究:结合遗传数据与行为观察,解析海洋鱼类社会群体维持的非亲属选择驱动因素
- 珊瑚礁鱼类种群动态分析:为珊瑚礁生态系统中翡翠珊瑚虾虎鱼的种群结构与动态研究提供基础数据