数据集概述
本数据集为2017年iGEM USP-Brazil团队筛选的共生转基因候选底盘生物信息，包含候选生物的物种、参考文献DOI、与宿主的生态关系、宿主节肢动物种类、靶向疾病、基因工程适用性等核心属性，支持合成生物学中底盘生物的筛选与评估。
文件详解
- 原始数据文件（original.tsv）
- 文件名称：Paratransgenesis - Candidate Chassis for iGEM USP-Brazil 2017 - original.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含organism（物种）、DOI（参考文献标识符）、relation with host（与宿主的生态关系）、host（宿主）、disease（靶向疾病）、genetic amenability（基因工程适用性）、evidence of horizontal transmission（水平传播证据）、evidence of vertical transmission（垂直传播证据）、stability in midgut (or targeted organ)（在中肠或靶器官的稳定性）等字段。
- 主数据文件（xlsx）
- 文件名称：Paratransgenesis - Candidate Chassis for iGEM USP-Brazil 2017.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：整合候选底盘生物的核心属性信息，字段与原始数据文件一致。
- Wikidata关联文件（wikidata.tsv）
- 文件名称：Paratransgenesis - Candidate Chassis for iGEM USP-Brazil 2017 - wikidata.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含带Wikidata ID的字段，如organism_QID（物种Wikidata ID）、DOI_QID（DOI的Wikidata ID）、disease_QID（疾病Wikidata ID）、host_QID（宿主Wikidata ID）等，关联数据集与Wikidata知识库。
数据来源
iGEM USP-Brazil 2017项目
适用场景
- 合成生物学底盘生物筛选: 评估候选生物的基因工程适用性、传播特性及宿主兼容性，辅助选择合适的共生转基因底盘。
- 疾病防控策略研究: 分析靶向特定疾病（如疟疾）的候选生物，为基于共生转基因技术的疾病防控提供数据支持。
- 基因工程工具开发: 基于候选生物的基因工程适用性数据，优化底盘生物的基因编辑工具与方法。
- 生物信息学关联分析: 通过Wikidata ID关联外部知识库，拓展候选生物的功能注释与数据挖掘维度。
