数据集概述
本数据集包含森莺科(Parulidae)鸟类性状演化研究的核心数据与分析代码,支持复现相关论文的分析结果。数据涵盖形态、鸣唱、颜色性状及标本参考信息,代码用于在R软件中执行演化模式、表型差异时间动态及性状演化速率分析,共11个文件。
文件详解
- 综合性状数据文件
- 文件名称:Parulidae_traitdata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含5个工作表,分别记录性状数据、性状解释、形态标本参考、鸣唱录音参考、光谱测量标本参考
- 独立CSV数据文件
- 文件名称:trait_data.csv、trait_explanation.csv、morpho_specimens.csv、song_recordings.csv、spectral_specimens.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:对应Excel文件的5个工作表内容,包括物种性状数值、性状定义、博物馆标本编号、鸣唱来源信息等
- 分析代码文件
- 文件名称:Parulidae_tempo-mode_code.txt、myRPANDA.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:主分析脚本包含演化模式、时间差异、演化速率三部分代码;辅助脚本为RPANDA包函数衍生代码
- 系统发育树文件
- 文件名称:mcct.tree、Barker100.txt
- 文件格式:TREE/TXT
- 字段映射介绍:最大分支可信度树及随机选择的100棵树,来源于Barker等2015年研究
数据来源
论文“A late burst of colour evolution in a radiation of songbirds (Passeriformes: Parulidae) suggests secondary contact drives signal divergence”
适用场景
- 鸟类演化模式研究: 拟合宏观演化模型分析森莺科形态、鸣唱、颜色性状的演化模式
- 表型差异时间动态分析: 探究森莺科辐射演化过程中表型差异的时间变化规律
- 性状演化速率评估: 分析不同性状在演化时间尺度上的速率变化特征
- 生物信号分化机制研究: 验证二次接触驱动森莺科物种信号分化的假说
- 博物馆标本数据整合: 关联形态、光谱测量标本信息开展跨维度分析