数据集概述
本数据集为R包pcadapt的模拟数据，用于支持选择基因组扫描分析。pcadapt通过主成分分析检测受选择基因，可处理缺失数据和混池测序数据，适用于混合个体且无需分组。数据集包含2个文件，涵盖不同进化模型的模拟场景，支持与其他基因组扫描工具对比分析。
文件详解
- README_for_simulations.txt
- 文件格式：TXT
- 内容介绍：说明数据集包含4个子文件夹，每个子文件夹对应特定进化模型的模拟场景，场景列表见filenames.txt；每个模拟场景关联5类文件，包括基因型矩阵、ped文件、map文件、.gt格式选择SNP列表、.pop格式群体标签文件。
- simulations.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：压缩包包含4个子文件夹，每个子文件夹对应特定进化模型的模拟数据，内部文件为README中描述的5类模拟相关文件。
数据来源
pcadapt R包相关研究
适用场景
- 基因组选择信号检测方法评估：对比pcadapt与BayeScan、hapflk等工具的假阳性率、功率及对混合个体的适应性。
- 进化模型模拟分析：基于不同模型的模拟数据，研究群体分化、范围扩张等场景下的选择信号特征。
- 分子生态学数据分析方法验证：测试pcadapt在下一代测序数据中的应用效果，优化基因组选择分析流程。
- 群体基因组学工具对比研究：利用模拟数据中选择SNP列表和群体标签，验证不同工具的检测准确性。
