数据集概述
本数据集记录PCB126暴露对斑马鱼胚胎m6A RNA修饰的影响,通过MeRIP-seq技术分析72小时胚胎暴露6小时后的m6A甲基化模式,识别出15个受PCB126差异甲基化的转录本,包括AHR激活相关基因(如ahrra、tiparp)及发育相关基因(如vgf、cebpd),共包含2个文件。
文件详解
- 文件名称:
MeRIP-InputRNA-DGE.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含MeRIP-seq输入RNA的差异基因表达(DGE)数据,记录DMSO对照组与PCB126暴露组的基因表达量及差异分析结果
- 文件名称:
Differential_m6A_methylation_DiffBind.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含m6A差异甲基化分析结果,记录两组样本的m6A峰分布、差异甲基化转录本信息及相关统计数据(如FDR、差异倍数)
适用场景
- 环境毒理学研究:分析PCB126等二噁英类化合物对发育过程中表观转录组的干扰机制
- 表观转录组学分析:探究m6A修饰在环境化学物暴露后的动态变化规律
- AHR信号通路研究:验证AHR激活相关转录本的m6A修饰调控模式
- 发育生物学研究:分析m6A修饰异常对斑马鱼胚胎发育关键基因表达的影响
- 污染物风险评估:为PCB126的发育毒性机制研究提供表观遗传层面的数据支持