数据集概述
本数据集为食管鳞癌免疫相关预后特征研究的原始数据,包含41个文件,涉及统计描述、分析代码、基因表达数据及实验流程文档。数据围绕免疫相关预后特征与放化疗敏感性的关联展开,支持食管鳞癌患者长期生存预测研究,涵盖基因表达、风险评分、免疫组化等多类信息。
文件详解
- 数据文件(.xlsx):共26个,如Figure 7C/D统计描述.xlsx、Riskscore of CRT cohort.xlsx等,包含各图表对应的统计分析数据、风险评分数据、差异基因分析数据等
- 代码文件(.R):共10个,如figure 8B:C codes.R、volcano plot.R等,包含Lasso回归、生存分析、热图绘制等分析代码
- 文档文件(.docx):共3个,如Immunohistochemical staining procedure.docx,包含免疫组化实验流程、Lasso回归筛选代码说明等
- 文本文件(.txt):共2个,如GSE45670_series_matrix.txt,为食管鳞癌及正常上皮组织的基因表达数据;ESCA_rnaseq_tpm.txt为食管鳞癌RNA-seq的TPM表达数据
数据来源
PeerJ论文“A novel immune-related prognostic signature based on Chemoradiotherapy sensitivity predicts long-term survival in patients with esophageal squamous cell carcinoma”
适用场景
- 食管鳞癌预后模型构建:基于免疫相关特征和放化疗敏感性数据,开发或验证患者长期生存预测模型
- 生物信息学分析:利用基因表达数据(如GSE45670、ESCA_rnaseq_tpm)开展差异基因、风险评分等分析
- 临床治疗策略研究:分析放化疗敏感性与免疫特征的关联,为食管鳞癌个体化治疗提供参考
- 实验方法参考:借鉴免疫组化流程文档,优化相关实验操作