数据集概述
本数据集包含PerformFISH项目（WP2）中开发的金头鲷（Sparus aurata）和欧洲海鲈（Dicentrarchus labrax）的所有验证引物列表，用于筛选可预测仔稚鱼质量性能的潜在生物标志物基因。数据以表格形式呈现，记录了引物的基因相关信息、序列参数及验证状态。
文件详解
- 文件名称：0-Primer Atlas Dl and Sau 2022_uploaded.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含Pathway（通路）、生理过程、蛋白质名称、基因代码、数据库登录号、引物序列（正向FW/反向RV）、熔解温度、扩增子大小、引物效率（eff%）、r²值、来源（in house或文献DOI）及验证状态（交通灯分类）等字段。
数据来源
PerformFISH项目（D2.3）
适用场景
- 水产养殖生物标志物研究：筛选金头鲷与欧洲海鲈仔稚鱼质量性能相关的基因生物标志物。
- 基因表达分析：利用验证引物进行目标基因的定量PCR检测与表达水平分析。
- 引物开发优化：参考引物序列参数（熔解温度、扩增效率等）优化水产养殖物种的基因检测方法。
- 水产动物生理机制研究：通过基因通路与生理过程关联分析，探究鱼类生长发育与质量性能的分子机制。
