数据集概述
本数据集围绕Midas慈鲷物种复合体的适应性辐射展开，聚焦厚唇形态（A. labiatus）与薄唇形态（A. citrinellus）的进化关系。通过RAD-seq技术获取基因组SNP数据，结合形态学、生态学指标，探究厚唇性状的起源（独立进化或基因交流）及种群结构、基因流模式，为进化生物学中趋同进化与适应性基因渗入的区分提供数据支持。
文件详解
- Readme__Pervasive_admixture_and_the_spread_of_a_large-lipped_form_in_a_cichlid_fish_radiation.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、样本信息、实验设计及数据使用说明等内容
- amp_eco_dataset.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含样本个体编号（ind）、物种（Species）、形态学指标（lip_rw1/head_rw1/body_rw1等形态主成分、standard_length标准体长、gutlength_ratio肠长比）、生态指标（d13C、d15N稳定同位素）、采样信息（Year年份、Lake湖泊、Location地点、latitude纬度、longti经度）等字段
- receipt-1.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含样本类型（Type）、 accession号（Accession）、唯一标识（Unique Name）、样本编号（Sample）等测序样本元数据
- receipt.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：推测为测序样本相关元数据文件，内容与receipt-1.tsv结构类似，记录样本的实验编号及标识信息
适用场景
- 适应性辐射进化机制研究：分析Midas慈鲷形态分化（厚唇/薄唇）与生态位适应的关联
- 种群基因组结构分析：利用SNP数据解析尼加拉瓜湖和马那瓜湖慈鲷种群的遗传分化与基因流模式
- 形态性状进化起源探究：验证厚唇性状是独立进化还是通过基因渗入在两湖间扩散
- 趋同进化与基因渗入区分：对比形态学与基因组数据，建立区分趋同进化和适应性基因渗入的分析框架
- 生态形态学关联分析：结合稳定同位素（d13C、d15N）与形态指标，研究食性生态位与形态适应性的关系
