数据集概述
本数据集围绕临床霍乱弧菌分离株与噬菌体之间的相互作用展开，聚焦SXT整合接合元件（ICEs）在噬菌体抗性和抗生素耐药性中的动态变化。通过时间移位实验，分析34个月采样周期内噬菌体抗性的波动规律，揭示SXT ICEs在噬菌体防御、有益移动元件限制及水平转移中的作用，为噬菌体治疗和病原体进化研究提供数据支持。
文件详解
- 系统发育树文件（NWK格式）
- 文件名称：WYL_FigS1A.nwk、TraI_FigS1B.nwk
- 文件格式：NWK（Newick）
- 字段映射介绍：存储系统发育树结构数据，用于展示霍乱弧菌菌株或TraI蛋白的进化关系，支撑噬菌体-细菌适应性相关的进化分析。
- 序列源数据文件（XLSX格式）
- 文件名称：Source_Data_Fig_S1A_WYL_sequemces.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含与图S1A相关的序列源数据，可能涉及霍乱弧菌菌株的基因序列信息，为噬菌体抗性元件的分子分析提供原始数据支持。
数据来源
论文“Temporal shifts in antibiotic resistance elements govern phage-pathogen conflicts”
适用场景
- 噬菌体-细菌互作机制研究: 分析临床霍乱弧菌分离株对不同时期噬菌体的敏感性变化，探究噬菌体抗性的分子基础。
- 抗生素耐药性动态分析: 研究SXT整合接合元件在霍乱弧菌种群中的时间动态，及其与抗生素耐药性传播的关联。
- 噬菌体治疗策略优化: 基于噬菌体抗性波动规律，为噬菌体治疗方案的设计和调整提供数据参考。
- 微生物水平基因转移研究: 分析噬菌体感染对SXT ICEs接合转移频率的影响，揭示移动遗传元件在病原体进化中的作用。
- 进化生物学研究: 利用系统发育树数据，探讨霍乱弧菌菌株或相关蛋白的进化关系及适应性进化机制。
