数据集概述
本数据集为竹节虫翅膀进化可逆性的宏进化分析研究提供支持,包含超300种竹节虫的基因序列、系统发育树、性状数据及分析文件。数据用于探究复杂性状(翅膀)在进化中丢失后重新获得的可能性,揭示翅膀进化的动态可逆过程,支持物种分化速率与性状进化关系的研究。
文件详解
- 基因序列文件(.fasta格式,共8个)
- 12s.fasta:12S基因序列比对文件
- 16s.fasta:16S基因序列比对文件
- 28s.fasta:28S基因序列比对文件
- COII.fasta:cox2基因序列比对文件
- FOL.fasta:cox1基因Folmer区域序列比对文件
- H3.fasta:H3基因序列比对文件
- COI.fasta:cox1基因序列比对文件
- 18s.fasta:18S基因序列比对文件
- 系统发育分析文件
- Beast_FC.xml:化石约束树的BEAST分析文件
- Beast_PC.xml:系统发育组学约束树的BEAST分析文件
- PC-Tree.nexus:系统发育组学约束树文件
- concatenation.nexus:基因序列串联比对文件
- 性状数据文件
- trait_2_states.txt:二态性状数据文件(含物种ID及性状编码)
- trait_3_states.txt:三态性状数据文件
- tree_annotation.tsv:系统发育树注释文件(含物种分类信息)
- 其他文件
- README.txt:数据集说明文件
- UC-Trees.txt:未约束树文件
- Tihelka_et_al_backbone.nwk:系统发育主干树文件
数据来源
论文“Macroevolutionary analyses provide new evidence of phasmid wings evolution as a reversible process”
适用场景
- 宏进化分析:研究竹节虫翅膀丢失与重新获得的进化过程
- 系统发育树构建:利用基因序列和约束文件构建竹节虫系统发育关系
- 性状进化研究:分析翅膀性状与物种分化速率的关联
- 进化模型验证:评估复杂性状可逆性的进化模型适用性
- 分子进化研究:基于多基因序列比对分析竹节虫的分子进化特征