数据集概述
本数据集围绕塔斯马尼亚古特有针叶树Pherosphaera hookeriana展开,包含其遗传多样性、种群结构及第四纪分布变化相关数据。研究基于核SSR和叶绿体SSR标记,结合化石记录、物种分布模型等,分析该物种在冰期退缩后的遗传特征,为濒危植物保护提供科学依据。
文件详解
- 全叶绿体基因组草稿文件
- 文件名称:Draft_whole_cp_genome_of_Pherosphaera_hookeriana.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含Pherosphaera hookeriana的全叶绿体基因组序列数据,用于遗传多样性和系统发育分析。
- 核SSR数据文件
- 文件名称:Pherosphaera_hookeriana_nSSR_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录23个种群的核SSR标记遗传数据,用于分析种群遗传结构和多样性。
- 化石花粉与大化石记录文件
- 文件名称:Pherosphaera_hookeriana_fossil_pollen_and_macrofossil_record.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含该物种的化石花粉及大化石记录信息,用于追溯第四纪分布变化。
- 叶绿体SSR数据文件
- 文件名称:Pherosphaera_hookeriana_cpSSR_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录叶绿体SSR标记数据,用于分析种群间的遗传分化和母系遗传特征。
数据来源
论文“The palaeoendemic conifer Pherosphaera hookeriana (Podocarpaceae) exhibits high genetic diversity despite Quaternary range contraction and post glacial bottlenecking”
适用场景
- 濒危植物遗传多样性评估: 利用核SSR和叶绿体SSR数据,分析Pherosphaera hookeriana的遗传多样性水平与种群结构,为保护策略制定提供依据。
- 第四纪植物分布变化研究: 通过化石记录数据,结合物种分布模型,探究该物种在冰期-间冰期的分布动态。
- 植物保护遗传学研究: 分析遗传多样性维持机制,如雌雄异株、多避难所存活等对物种存续的作用。
- 叶绿体基因组进化分析: 基于全叶绿体基因组序列,研究该物种的叶绿体基因组结构与进化特征。