数据集概述
本数据集为“Objective choice of phylogeographic models”研究的配套数据，包含20个实证系统发育地理数据集的输入文件、PHRAPL模型文件、分析脚本及结果文件。通过PHRAPL工具客观选择模型，验证研究者直觉选择的充分性，结果显示多数最佳模型需同时考虑基因流和种群分化参数，物种树方法对多数系统过于简化。
文件详解
- README_for_dryad.txt
- 文件格式：TXT
- 内容介绍：数据集说明文档，概述研究背景、文件组成（实证数据集输入文件、模型文件、函数文件等）及各文件用途。
- dryad.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：压缩包文件，包含：
- 实证数据集输入文件：以“phraplInput.rda”命名的R工作空间文件，含20个实证数据集的树、种群分配文件等输入数据
- 模型文件：MigrationArray_3pop_4K.rda（含78个PHRAPL模型的R工作空间文件）
- 函数文件：PhraplFunctions.rda（含所有PHRAPL分析函数的R工作空间文件）
- 脚本及结果文件：研究相关的分析脚本与结果输出文件
数据来源
Carstens et al.研究“Objective Choice of Phylogeographic Models”
适用场景
- 系统发育地理模型选择研究：验证客观模型选择工具与研究者直觉选择的差异，分析最佳模型特征
- 基因流与种群分化分析：通过实证数据集探索基因流和种群分化参数对系统发育地理模型的影响
- 生物信息学工具应用：基于PHRAPL工具开展系统发育地理模型的客观选择与验证
- 进化生物学研究：为解释生物遗传多样性的进化过程提供模型选择方法参考
