数据集概述
本数据集为欧洲悬铃木潜叶蛾(Phyllonorycter platani)的系统地理格局研究数据,包含284个个体(来自欧洲、亚洲、北美38个种群)的线粒体COI基因(1242bp)和核基因28S rDNA(893bp)序列分析结果,揭示了亚洲与欧洲两个地理分支的遗传差异及杂交区域,支持该物种的冰期避难所与近期扩张假说。
文件详解
- 样本信息文件:
- 文件名称:
samples.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含样本的种群来源、地理分布、个体编号等基础信息,支撑基因序列的地理关联分析
- 模型测试结果文件:
- 文件名称:
jmodeltest_pp.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测记录JModelTest软件对基因序列进化模型的测试参数与结果,用于系统发育分析的模型选择
- COI基因序列文件:
- 文件名称:
PP_COI.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含284个个体的线粒体COI基因序列数据,用于种群遗传结构与地理分支的构建
数据来源
论文“Phylogeographic pattern of the plane leaf miner, Phyllonorycter platani (STAUDINGER, 1870) (Lepidoptera: Gracillariidae) in Europe”
适用场景
- 昆虫系统地理学研究:分析悬铃木潜叶蛾的种群遗传结构、地理分支及冰期避难所分布
- 物种入侵与扩张历史追溯:结合遗传数据推断该物种在欧洲的定植与扩散路径
- 基因序列进化模型验证:利用JModelTest结果优化昆虫线粒体/核基因的进化分析模型
- 物种杂交区域与基因渐渗研究:通过两个地理分支的遗传差异与杂合个体数据,探究杂交机制与基因交流模式