数据集概述
本数据集为物种形成持续时间系统发育估计研究的支持数据，包含实现 protracted 物种形成模型参数估计的方法及模拟分析结果。通过模拟现存物种系统发育树，研究物种形成起始率、灭绝率、完成率及持续时间的估计效果，并应用于灵长类系统发育案例。数据集含2个文件，支持相关模型参数计算与模拟分析。
文件详解
- README_for_Etienne_et_al_-Evolution_2014-_supporting_data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据内容，包括PBD R包（用于估计PBD模型参数及物种形成持续时间特性）、Matlab代码pbd_sim_dens2.m（基于Gillespie算法模拟系统发育树）及pbd_sim_dens2*.out（系统发育分支时间模拟结果）等信息。
- Etienne_et_al_-Evolution_2014-_supporting_data.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包文件，包含实现protracted物种形成模型参数估计与模拟分析所需的代码及数据文件。
数据来源
论文“Estimating the duration of speciation from phylogenies”
适用场景
- 物种演化模型参数估计: 用于protracted物种形成模型中物种形成起始率、灭绝率等参数的计算与验证。
- 系统发育树模拟分析: 基于Gillespie算法模拟现存物种系统发育树，研究物种形成过程特性。
- 灵长类演化研究: 应用模型估计灵长类分支的物种形成持续时间，验证文献结论一致性。
- 生物信息学方法开发: 支持物种形成持续时间系统发育估计方法的实现与优化。
