数据集概述
本数据集为大象与人类祖先适应性进化的系统发育基因组分析数据，聚焦脑表达基因（如有氧能量代谢基因）的适应性进化模式。通过对比大象、人类、马岛猬、小鼠的基因组数据，分析核苷酸替代率、dN/dS比值及功能基因类别，探究大象与人类在大脑部、长寿命特征下的适应性进化趋同性，共包含4个压缩文件。
文件详解
- 压缩文件包
- 文件名称：Human Ancestry DAVID output.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含人类祖先适应性进化基因的DAVID功能富集分析结果，涉及基因本体（GO）分类、通路注释等信息。
- 压缩文件包
- 文件名称：Codeml Results .zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含Codeml分析结果，涉及基因的非同义/同义核苷酸替代率（dN/dS）计算数据，用于评估适应性进化强度。
- 压缩文件包
- 文件名称：Bin DAVID output.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含适应性进化基因的DAVID功能富集分析结果（Bin分组），涉及基因功能类别、通路注释等信息。
- 压缩文件包
- 文件名称：Top 5% DAVID output.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含前5%高dN/dS比值基因的DAVID功能富集分析结果，聚焦强适应性进化基因的功能特征。
数据来源
论文“Phylogenomic analyses reveal convergent patterns of adaptive evolution in elephant and human ancestries”
适用场景
- 基因组适应性进化研究: 分析大象与人类祖先基因的核苷酸替代率、dN/dS比值，探究适应性进化模式。
- 脑表达基因功能分析: 研究有氧能量代谢等脑表达基因在大象与人类中的适应性进化特征，关联大脑部、长寿命表型。
- 进化趋同性研究: 对比大象、人类与马岛猬、小鼠的进化模式，揭示跨物种适应性进化的趋同机制。
- 功能基因富集分析: 利用DAVID输出结果，挖掘适应性进化基因的功能类别及通路，解析进化的分子基础。
