Phylogeographic_Based_合唱蛙物种复合体系统发育地理推断数据

数据集概述

本数据集为合唱蛙物种复合体(含伊利诺伊合唱蛙及斯特雷克合唱蛙)的系统发育地理研究数据,采用贝叶斯模型比较方法分析遗传结构与生物地理历史。包含多类型遗传标记(核基因座、线粒体基因、微卫星位点)及相关分析文件,共12个文件,支持不同演化时间尺度的研究。

文件详解

  • 压缩文件(Archive files,共11个,格式:ZIP)
  • *BEAST_nDNA.zip:核基因相关BEAST分析文件
  • Alignments.zip:序列比对文件
  • BEAST_DivTime.zip:分歧时间分析相关BEAST文件
  • RAxML_mtDNA.zip:线粒体基因RAxML分析文件
  • Migrate-n.zip:基因流分析相关Migrate-n文件
  • ReadsByIndividual.zip:个体测序读长相关文件
  • BEAST_mtDNA.zip:线粒体基因相关BEAST分析文件
  • IMa2.zip:种群分化与迁移分析相关IMa2文件
  • 数据文件(Data files,共1个,格式:XLSX)
  • README_for_ReadsByIndividual.xlsx:个体测序读长文件的说明文档

数据来源

论文“Phylogeographic inference using Bayesian model comparison across a fragmented chorus frog species complex”

适用场景

  • 系统发育地理学研究:分析合唱蛙物种复合体的遗传结构、种群分化与生物地理历史
  • 遗传标记应用评估:比较核基因座、线粒体基因、微卫星位点在不同演化时间尺度的研究价值
  • 种群动态分析:基于基因流、分歧时间等数据推断种群扩张路线与避难所分布
  • 保护单元划分:为合唱蛙物种复合体的遗传管理单元界定提供数据支持
  • 贝叶斯模型比较方法验证:测试该方法在碎片化物种系统发育地理推断中的适用性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 285.11 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。