数据集概述
本数据集为合唱蛙物种复合体(含伊利诺伊合唱蛙及斯特雷克合唱蛙)的系统发育地理研究数据,采用贝叶斯模型比较方法分析遗传结构与生物地理历史。包含多类型遗传标记(核基因座、线粒体基因、微卫星位点)及相关分析文件,共12个文件,支持不同演化时间尺度的研究。
文件详解
- 压缩文件(Archive files,共11个,格式:ZIP)
- *BEAST_nDNA.zip:核基因相关BEAST分析文件
- Alignments.zip:序列比对文件
- BEAST_DivTime.zip:分歧时间分析相关BEAST文件
- RAxML_mtDNA.zip:线粒体基因RAxML分析文件
- Migrate-n.zip:基因流分析相关Migrate-n文件
- ReadsByIndividual.zip:个体测序读长相关文件
- BEAST_mtDNA.zip:线粒体基因相关BEAST分析文件
- IMa2.zip:种群分化与迁移分析相关IMa2文件
- 数据文件(Data files,共1个,格式:XLSX)
- README_for_ReadsByIndividual.xlsx:个体测序读长文件的说明文档
数据来源
论文“Phylogeographic inference using Bayesian model comparison across a fragmented chorus frog species complex”
适用场景
- 系统发育地理学研究:分析合唱蛙物种复合体的遗传结构、种群分化与生物地理历史
- 遗传标记应用评估:比较核基因座、线粒体基因、微卫星位点在不同演化时间尺度的研究价值
- 种群动态分析:基于基因流、分歧时间等数据推断种群扩张路线与避难所分布
- 保护单元划分:为合唱蛙物种复合体的遗传管理单元界定提供数据支持
- 贝叶斯模型比较方法验证:测试该方法在碎片化物种系统发育地理推断中的适用性