数据集概述
本数据集为HPAI相关eDNA研究论文配套的18S宏条形码数据，包含3个文件。通过对HPAI受影响 poultry farms及鸟类庇护所的空气颗粒物样本进行eDNA测序，分析野水鸟DNA的存在情况，探究HPAI病毒通过空气入口进入 poultry farms的潜在传播路径，为生物安全防控提供数据支持。
文件详解
- 文件名称：Final_metadata_paper.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含研究样本的元数据信息，可能涉及样本采集地点（poultry farms、鸟类庇护所的室内/室外）、样本类型、采集时间等实验相关元数据
- 文件名称：Final_taxonomytable_paper.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含18S rRNA基因扩增子测序得到的分类学注释结果，可能涉及物种名称、分类层级、序列丰度等分类学数据
- 文件名称：Final_HPAI-eDNA_phyloseq_paper.RDS
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：基于phyloseq格式存储的eDNA宏条形码数据对象，整合了测序数据、分类学信息及样本元数据，适用于R语言环境下的生物信息学分析
适用场景
- HPAI病毒传播路径研究: 分析野水鸟DNA在 poultry farms空气入口处的分布，探究HPAI病毒通过空气传播的潜在路径
- 生物安全防控评估: 利用eDNA宏条形码技术检测空气样本中的宿主DNA，评估 poultry farms生物安全风险
- 野生动物eDNA检测技术应用: 验证18S宏条形码技术在空气样本中野鸟eDNA检测的有效性与灵敏度
- 禽流感流行病学分析: 结合样本元数据与分类学数据，分析HPAI疫情与野鸟分布的关联性
