数据集概述
本数据集聚焦黑云杉(Picea mariana)与红云杉(Picea rubens)的种间渐渗基因组研究,通过对33个种群的385株个体进行12个连锁群上300个SNPs的基因分型,分析种间渐渗的异质性模式,揭示物种形成进程中基因组的渗透差异及选择作用,为物种界定提供依据。
文件详解
- 文件名称:
Complete genotype data_385individuals_300loci.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含385株云杉个体(来自黑云杉与红云杉的异域分布区及同域分布区)的300个SNP位点基因型数据,位点覆盖黑云杉12个连锁群,可用于分析种间基因渐渗模式、筛选受选择位点及评估物种形成进程。
数据来源
论文“Tracking the progression of speciation: variable patterns of introgression across the genome provide insights on the species delimitation between progenitor-derivative spruces (Picea mariana × P. rubens)”
适用场景
- 物种形成进程研究:分析黑云杉与红云杉基因组渐渗的异质性,探究年轻未完成物种形成的分子机制。
- 基因组渐渗模式分析:识别种间基因流的渗透区域与不可渗透区域,筛选受分化选择的位点。
- 物种界定与遗传谱系研究:基于基因组差异位点界定物种边界,解析遗传谱系的分化与维持机制。
- 种群基因组学方法验证:验证整合三种种群基因组方法扫描基因组的分析框架,为其他物种形成研究提供参考。