数据集概述
本数据集是对平滑黑珊瑚ITS序列的重新分析结果，基于原始研究的色谱图，通过序列组装、杂合子检测与分相、多序列比对及单倍型网络分析，验证了所有样本为同一物种的结论，包含分析过程中的原始数据与结果文件。
文件详解
- 压缩文件夹：Leiopathes_ITS_chromatograms.zip，ZIP格式，包含作者提供的原始色谱图文件
- Sequencher项目文件：Leiopathes_ITS_Sequencher.spf，.spf格式，存储色谱图组装为contigs、清理及分相后的项目数据
- 序列比对文件：Leiopathes_ITS_MAFFT-E-INS-i.fasta，FASTA格式，为分相序列经MAFFT E-INS-i模式比对后的结果
- 单倍型网络分析项目文件：Leiopathes_ITS_JSON.HaplowebMaker，JSON格式，记录HaplowebMaker分析的结果数据
- 单倍型网络结果文件：Leiopathes_ITS_haploweb.pdf，PDF格式，展示最终单倍型网络的可视化结果
数据来源
原始数据来自Ruiz-Ramos DV等2015年发表于PLoS ONE的研究（DOI:10.1371/journal.pone.0138989），色谱图由该研究作者提供
适用场景
- 分子系统学研究：分析平滑黑珊瑚的物种界定及遗传多样性
- 生物信息学方法验证：验证单倍型网络分析在物种分类中的应用
- 珊瑚分子生态学研究：探究深海黑珊瑚的种群遗传结构
- 生物多样性保护：为平滑黑珊瑚的保护策略制定提供遗传数据支持
