数据集概述
本数据集包含基于21个均匀分布于松属主要分支的化石,结合节点定年和端点定年方法生成的贝叶斯分子系统发育树及相关文件。数据旨在解决现有研究中松属主要分支分化时间估算的差异,提供更可靠的分化时间参考,支持松属多样化过程与地质或气候事件关联分析。
文件详解
- 系统发育树文件(.tre格式,共11个)
- 示例文件:NDns_MCC_commAnc.tre、NDbl_MCC_commAnc.tre、NDbs_MCC.tre、FBDs_ageRange_MCC_extant_commAnc.tre
- 内容说明:包含基于不同定年方法生成的最大可信度树(MCC),部分文件记录共同祖先节点信息
- 系统发育树集合文件(.trees格式,共10个)
- 示例文件:NDnl_combined.trees、FBDs_combined_extant.trees、FBDl_ageRange_combined_extant.trees、NDul_combined.trees、NDus_combined.trees、NDbs_combined.trees
- 内容说明:包含多种定年方法(节点定年ND、化石分支定年FBD)下的系统发育树集合,部分文件限定现存物种范围或包含年龄区间信息
- 分析配置文件(.xml格式,共10个)
- 示例文件:NDnl.xml、NDus.xml、NDns.xml
- 内容说明:贝叶斯分析的参数配置文件,记录定年方法、化石使用、模型设置等元数据
数据来源
论文“Fossils matter: improved estimates of divergence times in Pinus reveal older diversification”
适用场景
- 松属系统发育研究:分析松属起源及主要分支的分化时间,验证早期白垩纪起源假说
- 化石定年方法比较:对比节点定年与端点定年方法对分化时间估算结果的影响
- 植物进化与环境关联分析:将松属分化时间与地质事件、气候变化关联,探究多样化驱动因素
- 系统发育不确定性评估:利用多组树文件量化分化时间估算的不确定性,支持比较系统发育研究