数据集概述
本数据集围绕新西兰两种木本植物类群（Coprosma和Veronica），探究全基因组复制（WGD）对生物群落迁移的影响。通过分析不同倍性水平物种的生物群落占据情况（森林、开阔地、高山），验证多倍体是否提升生物群落迁移速率。数据集包含30个文件，涵盖代码脚本、倍性数据、模型比较表、系统发育树等，支持相关统计检验与模型分析。
文件详解
- 代码文件（.r，16个）
- 代表文件：independence_test_script.R、CoprosmaBSM2.R、VeronicaBAYAREA.R
- 功能：实现统计检验、生物地理模型（如BioGeoBEARS）、模型比较及可视化等分析流程
- 文本数据文件（.txt，8个）
- 代表文件：timeperiods.txt、coprosma_ploidy.txt、veronica_ploidy.txt
- 内容：记录物种倍性信息（如coprosma_ploidy.txt含物种倍性标注）、时间周期及单一群落数据等
- 表格数据文件（.xlsx/.csv，4个）
- 代表文件：veronica_model_comparison.xlsx、independence_test_data.csv
- 字段示例：Genus（属）、Species（种）、Forest/Open/Alpine（群落类型）、multi.biomes（多群落占据）、wgd low/high（倍性水平）
- 系统发育树文件（.newick，2个）
- 代表文件：nz_veronica_tree.newick、nz_coprosma_tree.newick
- 格式：Newick格式，存储植物类群的系统发育关系
适用场景
- 植物基因组学研究：分析全基因组复制对植物生态适应性的影响机制
- 生物地理学分析：探究不同倍性植物的生物群落占据模式与迁移速率
- 统计模型验证：利用代码脚本复现生物群落与倍性水平的独立性检验及模型比较
- 植物生态学研究：支撑多倍体植物生态扩张能力的实证分析
- 系统发育分析：结合系统发育树研究物种演化与生物群落迁移的关联
