数据集概述
本数据集围绕piRNA引导的沉默机制展开，包含通过大规模平行细胞实验获取的相关数据文件，涉及小RNA、sgRNA等序列信息及实验设计列表，支持piRNA功能与沉默机制的研究，共包含5个文件。
文件详解
- 数据文件（data_files）
- 文件名称：Tn_smallRNA_MPRA_list_v1.xlsx、Tn_smallRNA_MPRA_list_v2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含MPRA实验设计中的小RNA序列列表相关信息
- 文件名称：TN_sgRNA_list_pilot_v1.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含contig、start、stop、target、context、overflow、orientation、Doench2014OnTarget、DoenchCFD_maxOT、DoenchCFD_specificityscore、Moreno-Mateos2015OnTarget、dangerous_GC、dangerous_polyT、dangerous_in_genome、Hsu2013等sgRNA序列设计及活性预测相关字段
- 其他文件（other_files）
- 文件名称：tn1.hairpin.miRNA.fa、tn1.mature.miRNA.fa
- 文件格式：FA
- 字段映射介绍：包含miRNA的发夹结构及成熟序列信息
适用场景
- piRNA引导沉默机制研究: 分析piRNA在沉默过程中的作用模式与分子机制
- 大规模平行细胞实验设计参考: 基于MPRA及sgRNA列表优化piRNA相关实验方案
- 小RNA序列功能分析: 通过小RNA及miRNA序列数据探究其与piRNA沉默的关联
- 基因编辑靶点效率预测: 利用sgRNA列表中的活性预测字段评估靶点设计效果
