数据集概述
本数据集包含两种杂交凤梨科植物（Pitcairnia属）的叶片和花转录组数据，涵盖从头组装结果、功能注释信息及候选基因分析。数据识别了与传粉者吸引、生殖隔离相关的候选基因，涉及类黄酮和花青素生物合成途径的关键酶及转录因子，还提供了微卫星位点信息，为研究植物适应性分化与生殖隔离分子机制提供资源。
文件详解
- 表格文件
- 文件名称：Table S1_The GOs classifcation all leaves.xlsx、Table S2_Keeg pathways.docx、Table S3_List of candidate genes.docx、Table SSR Primers designed.xls
- 文件格式：XLSX、DOCX、XLS
- 字段映射介绍：包含基因本体（GO）分类、KEGG通路注释、候选基因列表、SSR引物设计信息等功能注释与分子标记数据
- 压缩文件
- 文件名称：Phylogeny alignments.rar、FPKM values for each transcriptome.rar、Contigs of each transcriptome.rar
- 文件格式：RAR
- 字段映射介绍：包含系统发育比对数据、转录组FPKM表达量数据、转录组组装contigs序列数据
数据来源
论文“De novo assembly and characterization of leaf and floral transcriptomes of the hybridizing bromeliad species (Pitcairnia spp.) adapted to Neotropical Inselbergs”
适用场景
- 植物转录组学研究: 用于分析凤梨科植物叶片和花组织的基因表达特征与功能注释
- 生殖隔离分子机制探究: 通过候选基因分析传粉者介导的生殖隔离相关分子通路
- 植物色素合成研究: 基于类黄酮和花青素生物合成途径基因，研究花颜色调控机制
- 分子标记开发: 利用微卫星位点数据开展种群遗传学与适应性进化研究
- 植物进化生物学分析: 通过转录组数据解析杂交植物的适应性分化与物种形成过程
