数据集概述
本数据集为墨西哥西部淡水鱼_Poecilia butleri_历史基因流研究数据,包含264个个体的线粒体DNA(细胞色素b)序列分析结果,涉及4个淡水生态区、34个采样点,验证生态区边界与大陆架宽度对基因流的影响,含8个分析相关文件。
文件详解
- 分子数据文件
- 文件名称:poecilia.butt.only.cb.nex、Pbutleri only HAPLOTYPES.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含_Poecilia butleri_细胞色素b基因序列数据及单倍型数据,用于系统发育分析
- 种群遗传分析文件
- 文件名称:FINAL_Pbutleri_arlequin.arp、Pbutleri_SAMOVA_inputfile.arp、FINAL_Pbutleri_arlequin_haplotype.hap、Pbutleri_SAMOVA_inputfile_geography.geo
- 文件格式:ARP、HAP、GEO
- 字段映射介绍:Arlequin与SAMOVA分析输入文件,含单倍型数据、地理信息,用于分子方差分析及空间遗传结构分析
- 文档与元数据文件
- 文件名称:table1.rtf、pbutt.xml
- 文件格式:RTF、XML
- 字段映射介绍:研究相关表格文档及元数据文件,记录研究设计与数据说明
数据来源
论文“Do freshwater ecoregions and continental shelf width predict patterns of historical gene flow in the freshwater fish Poecilia butleri?”
适用场景
- 淡水鱼类种群遗传学研究:分析_Poecilia butleri_的遗传多样性与种群结构
- 生态因子对基因流影响研究:验证淡水生态区边界、大陆架宽度等因子对基因流的作用机制
- 分子生态学分析方法应用:使用系统发育树、单倍型网络、分子方差分析等方法的实践参考
- 淡水生物地理格局研究:探讨地质与生物因素交互对淡水物种遗传多样性空间分布的影响