数据集概述
本数据集围绕花鳉科（Poeciliidae）鱼类胎盘的重复独立起源展开，包含胎盘表型、生命史特征及基因组进化相关数据，用于验证胎盘进化中趋同与分化的表型特征，及其与分子水平趋同的关联，支持胎盘器官进化机制的比较研究。
文件详解
- 系统发育树文件
- 文件名称：Hard_IR_PoeciliidaeOnly_name_update.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：花鳉科物种的系统发育树，用于比较胎盘进化的亲缘关系背景
- 数据分析脚本文件
- 文件名称：PGLS_script_upload.Rmd、Linear_mixed_model.Rmd
- 文件格式：RMD
- 字段映射介绍：包含系统发育广义最小二乘法（PGLS）和线性混合模型的分析代码，用于关联表型与分子进化数据
- 模型数据文件
- 文件名称：mixed_model_data.xlsx、PGLS_yps_mfw.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：用于混合模型和PGLS分析的结构化数据，包含胎盘表型与生命史特征的关联变量
- 原始数据表文件
- 文件名称：raw_data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含物种（Species）、个体（Individual）、胎盘数量（Placenta number）、发育阶段（Develo. stage）、母体权重（mfw）、幼体大小（yps）、雌性体长（Female_sl）等原始观测数据
数据来源
论文“Repeated independent origins of the placenta reveal convergent and divergent organ evolution within a single fish family (Poeciliidae)”
适用场景
- 生物进化研究：分析花鳉科胎盘趋同与分化的表型特征及其进化机制
- 器官进化机制研究：验证胎盘这一复杂器官在近缘物种中的重复独立起源模式
- 分子进化关联分析：探究胎盘表型与基因组进化速率的相关性
- 生命史策略研究：关联胎盘表型与母体-幼体能量分配等生命史特征的进化适应
- 比较生物学分析：利用系统发育树和表型数据开展跨物种的进化比较研究
