数据集概述
本数据集围绕澳大利亚中部鬃狮蜥(Pogona vitticeps)的温度性别反转现象展开,包含野外采集样本的基因型/表型性别鉴定结果、推断的孵化环境参数(如温度、风速等)及种群遗传结构数据。通过多模型分析探究性别反转的空间分布与环境条件、遗传结构的关联,为理解爬行动物应对气候变化的适应性机制提供支持。
文件详解
- 数据文件(.csv、.xlsx、.rds、.zip)
- 环境参数文件:如
randomlocations_rhtmax.csv(相对湿度最大值)、randomlocations_vp.csv(水汽压)、randomlocations_maxtemp.csv(最高温度)等,格式为CSV,包含location_id、variable及按天(day0001至dayxxx)记录的环境变量值
- 样本数据文件:
Field_Pogona_Data.xlsx,格式为XLSX,包含样本采集信息及关联的环境数据;Figure1_SupplementaryData.xlsx,格式为XLSX,为补充图表数据
- 辅助数据文件:
randomlocations_windSpeed.zip(风速数据压缩包)、Castelli_RandomLocations_GMToffset.rds(时区偏移数据)
- 代码文件(.R、.py)
- R脚本:如
Castelli_MicroclimateAndCTE_RandomLocations.R(微气候分析)、pogona_dart_analysis_Aug2020.R(遗传数据分析)等,共8个R文件
- Python脚本:
silo_data_extraction.py,用于提取SILO数据库环境数据
- 其他文件
- 说明文件:
README.txt,包含数据集研究背景及文件说明
- 遗传数据文件:
pogona_dart_genlight,无后缀,为种群遗传结构数据
数据来源
论文“Evolving thermal thresholds explain the distribution of temperature sex reversal in an Australian dragon lizard”
适用场景
- 爬行动物性别决定机制研究:分析温度对鬃狮蜥ZZ基因型向雌性表型反转的影响
- 气候变化适应性评估:探究温度阈值的遗传适应如何缓冲高温对种群性比的影响
- 环境因子关联分析:研究孵化期气候变量(温度、湿度等)与性别反转分布的关系
- 种群遗传结构分析:利用简化基因组测序数据解析鬃狮蜥的种群分化模式
- 生物地理学研究:结合空间分布数据,分析性别反转现象的地理限制因素