数据集概述
本数据集包含用于多倍体物种亲子鉴定排除分析的PolyPatEx R包相关数据，涵盖微卫星标记数据、示例脚本及模拟文件。支持4n、6n、8n等倍性的同源多倍体物种，可处理已知等位基因拷贝数（基因型）或未知（等位表型）的标记数据，通过等位基因匹配排除与母子对不兼容的候选父本，为群体遗传学家研究多倍体交配模式提供工具支持。
文件详解
- 代码与脚本文件
- 文件名称：Example.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：提供PolyPatEx包的示例分析脚本，用于演示亲子鉴定排除分析流程。
- 数据文件
- 文件名称：GF_Phenotype.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含id（个体ID）、popn（群体）、mother（母本）及locus149a至locus223f等微卫星标记的等位表型数据（未知拷贝数）。
- 文件名称：FR_Genotype.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含id（个体ID）、popn（群体）、mother（母本）、gender（性别）及SB85a至SB24d等微卫星标记的基因型数据（已知拷贝数）。
- 压缩文件
- 文件名称：Simulation_scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含模拟分析相关的脚本文件。
- 文件名称：COLONY_data_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含COLONY软件相关的数据文件。
数据来源
PolyPatEx: an R package for paternity exclusion in autopolyploids
适用场景
- 多倍体物种亲子鉴定排除分析: 利用PolyPatEx包分析微卫星标记数据，排除与母子对基因型/表型不兼容的候选父本。
- 多倍体群体交配模式研究: 通过亲子鉴定结果分析多倍体物种的交配系统、父本贡献及繁殖策略。
- 微卫星标记数据处理方法研究: 比较已知/未知等位基因拷贝数数据的分析流程及结果差异。
- 群体遗传学软件工具开发: 为多倍体亲子鉴定分析软件的开发与优化提供数据支持。
