数据集概述
本数据集包含针对新西兰保护关注蛙类Leiopelma hochstetteri的20个种群的池化样本并行标记下一代测序数据，用于评估该方法在生态保护领域种群遗传分析中的准确性与实用性。数据对比了池化NGS与个体Sanger测序的种群遗传参数（核苷酸多样性π、分化指数FST），验证了池化方法的可靠性。
文件详解
- 池化样本测序文件（.sff格式）
- 文件名称：Pop1.sff、Pop2.sff、…、Pop17.sff等20个文件
- 文件格式：SFF
- 内容说明：20个莱奥佩尔马蛙种群的16S和Cyt b基因池化样本测序原始数据
- 参考序列文件（.txt格式）
- 文件名称：16S_reference.txt、CytB_reference.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：包含16S和Cyt b基因的参考共识序列，用于测序数据比对与分析
- 结果表格文件（.xlsx格式）
- 文件名称：Table1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：记录两种测序方法（池化NGS与个体Sanger）得到的种群遗传参数（π、FST）对比数据
数据来源
论文“Parallel tagged next-generation sequencing on pooled samples – a new approach for population genetics in ecology and conservation”
适用场景
- 种群遗传多样性评估：利用池化NGS数据快速分析莱奥佩尔马蛙种群的核苷酸多样性（π），支撑物种保护状态评估
- 种群结构分化研究：通过FST参数分析种群间遗传分化程度，识别关键保护单元
- 测序方法比较验证：对比池化NGS与传统Sanger测序的准确性，优化生态保护领域种群遗传分析技术方案
- 保护遗传学应用：为濒危两栖类物种的快速遗传监测提供方法参考与数据支撑
