数据集概述
本数据集通过60k SNP芯片对美洲14国206头乡村猪及183头潜在奠基猪(含野猪、伊比利亚猪、国际及中国品种)进行基因分型,研究美洲猪群殖民历史与适应性进化。数据揭示其以欧洲血统为主的复杂遗传结构,及心血管系统相关基因在高原与海平面猪群中的分化。
文件详解
- README_for_FinalData_HDY-12-OR0223.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据对应论文、联系人信息,数据集包含46259个SNP基因型(389个个体),Info_sample.txt含样本来源和群体信息,MPE_378.为论文分析用基因型数据(PLINK格式),MPE_389.包含更多样本基因型。
- FinalData_HDY-12-OR0223.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含上述所有数据文件,包括样本信息文件和PLINK格式基因型文件。
数据来源
论文“Porcine colonization of the Americas: A 60k SNP story” W. Burgos, C.A. Souza et al.
适用场景
- 猪群遗传多样性研究:分析美洲乡村猪与潜在奠基猪的遗传关系及种群结构。
- 适应性进化研究:探究极端气候下美洲猪群快速适应的遗传机制,尤其是心血管系统相关基因。
- 物种殖民历史重建:通过SNP数据追溯美洲猪群的起源及扩散路径。
- 分子育种应用:为猪的遗传改良提供种群遗传结构和适应性基因的参考依据。