数据集概述
本数据集为印度洋西部多孔鹿角珊瑚白斑综合征（PWPS）病原菌鉴定研究相关数据，包含16S rRNA基因、pyrH基因等的序列文件、系统发育树文件、细菌培养及感染试验相关数据文件，用于支持PWPS病原菌的分离、鉴定及温度依赖性分析。
文件详解
- 基因序列文件（.fasta格式，共5个）
- 文件名称：PWPS bacterial cultures.fasta、Bacterial candidates (Infection trials).fasta、Nucleotide alignment (16S rRNA gene).fasta、Nucleotide alignment (pyrH gene).fasta、MLST alignment.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含PWPS相关细菌培养株、感染试验候选菌株的核苷酸序列，以及16S rRNA基因、pyrH基因、MLST的核苷酸比对序列
- 系统发育树文件（.newick格式，共3个）
- 文件名称：Tree for the 16S rRNA gene.newick、Tree for the pyrH gene.newick、Consensus tree (concatanation).newick
- 文件格式：NEWICK
- 字段映射介绍：包含16S rRNA基因、pyrH基因的系统发育树，以及串联序列的共识系统发育树
- 细菌培养及比对结果文件（.xlsx格式，1个）
- 文件名称：PWPS bacterial cultures (corresponding codes and blast results).xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含PWPS细菌培养株的对应编号及BLAST比对结果信息
数据来源
论文“Identification of a bacterial pathogen associated with Porites white patch syndrome in the Western Indian Ocean”
适用场景
- 珊瑚疾病病原菌鉴定研究：通过基因序列及比对结果分析PWPS相关病原菌的分类及亲缘关系
- 珊瑚疾病分子机制研究：利用基因序列及系统发育树数据探究病原菌与PWPS发病的分子关联
- 珊瑚疾病温度依赖性分析：结合实验数据研究温度对PWPS发病率及组织损失的影响
- 海洋微生物多样性研究：分析印度洋西部珊瑚礁环境中与PWPS相关的细菌群落多样性
