数据集概述
本数据集为论文“Portimine A toxin causes skin pathology through ZAKα-dependent NLRP1 inflammasome activation”中Figure 1C对应的LC-MS/MS原始数据,包含塞内加尔环境样本中微藻毒素的定量分析结果,共12个文件,支持对Portimine A等毒素的检测与分析。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称:Data220801_DAKAR_MRM_Mussel_V_Netbiomass_II.wiff、Data220802_DAKAR_MRM_Mussel_V_Netbiomass_II_dilution.wiff、Data220421_DAKAR_MRM_Canoebiomass_I_Seawater_IV.wiff
- 文件格式:.wiff
- 字段映射介绍:Analyst软件生成的原始数据文件,包含质谱采集的原始信号信息
- 扫描数据文件
- 文件名称:Data220801_DAKAR_MRM_Mussel_V_Netbiomass_II.wiff.scan、Data220802_DAKAR_MRM_Mussel_V_Netbiomass_II_dilution.wiff.scan、Data220421_DAKAR_MRM_Canoebiomass_I_Seawater_IV.wiff.scan
- 文件格式:.scan
- 字段映射介绍:对应.wiff文件的扫描数据,记录质谱扫描的详细参数与信号
- 定量结果文件
- 文件名称:Quanti_MRM_biomass_net_and_mussel.xlsx、Quanti_MRM_filters_seawater_and_canoe_biomass.xlsx
- 文件格式:.xlsx
- 字段映射介绍:环境样本(生物量、贻贝、海水等)中Portimine A等毒素的定量分析结果表格
- 转换数据文件
- 文件名称:MZML_files.zip
- 文件格式:.zip
- 字段映射介绍:包含转换为.mzML格式的开源数据文件,支持独立分析
- 说明文档
- 文件名称:README.txt
- 文件格式:.txt
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据来源、格式说明及分析工具推荐
- 方法与列表文件
- 文件名称:Skyline_TransitionList_Portimines_Pinnatoxins.csv、Skyline_Method_Portimines_Pinnatoxins.skyd
- 文件格式:.csv、.skyd
- 字段映射介绍:Skyline软件分析所用的过渡列表(包含分子名称、质荷比、碰撞能等参数)及方法文件
数据来源
EMBO Molecular Medicine论文“Portimine A toxin causes skin pathology through ZAKα-dependent NLRP1 inflammasome activation”
适用场景
- 微藻毒素定量分析:用于检测环境样本中Portimine A等微藻毒素的含量
- 生物医学研究:支持Portimine A毒素致皮肤病理机制相关的分子生物学研究
- 环境监测:分析塞内加尔区域环境样本(贻贝、海水、生物量)的毒素污染情况
- 质谱数据分析方法优化:基于原始数据与转换数据,优化LC-MS/MS定量分析流程