数据集概述
本数据集包含深海海胆科（Pourtalesiidae）及相关科属（如Ceratophysidae、Calymnidae、Carnarechinidae）的四种遗传标记（COI、12S、16S、28S）的比对序列，以及串联修剪序列、分区方案、比对整理说明和凭证标本信息。数据集共9个文件，覆盖原始与处理后的基因序列及元数据，支持深海海胆的系统分类与遗传研究。
文件详解
- 基因序列文件（.fas格式，共5个）
- Pourtalesiidae_COI.fas：未修改的COI基因部分序列比对
- Pourtalesiidae_12S.fas：未修改的12S rRNA基因部分序列比对
- Pourtalesiidae_16S.fas：未修改的16S rRNA基因部分序列比对
- Pourtalesiidae_28S.fas：未修改的28S rRNA基因部分序列比对
- Pourtalesiidae_concatenated_trimmed.fas：四种遗传标记的修剪比对序列串联数据集
- 分区方案文件
- Pourtalesiidae_concatenated_trimmed_partition.txt：串联修剪序列的分区方案
- 比对整理说明文件
- Alignment_curation.txt：序列比对整理流程的详细描述，包括使用Geneious Prime软件组装、MAFFT插件（E-INS-I策略）比对等步骤
- 凭证标本信息文件
- Vouchers and accession numbers.docx：包含标本鉴定、凭证号及GenBank登录号的表格
- 说明文件
- README.rtf：数据集说明文档
适用场景
- 深海海胆系统分类研究：通过多基因标记序列分析Pourtalesiidae科及相关类群的亲缘关系与分类地位
- 遗传多样性分析：基于线粒体与核基因标记，探究深海海胆的种群遗传结构与演化历史
- 分子系统发育构建：利用串联基因序列及分区方案，构建深海海胆的系统发育树
- 分类学验证：支持对“Ceratophysidae”等新科的分类学假设验证
- 标本资源追溯：通过凭证标本信息关联基因序列与实体标本，为后续研究提供参考
