数据集概述
本数据集为PR2数据库的5.1.0版本，由多位研究者共同整理，涵盖了Chloropicophyceae、Apicomplexa、Picozoa、Rhodophyta等多个生物类群的核糖体相关数据，包含序列文件、分类信息及训练模型等多种格式文件。
文件详解
该数据集包含十一个文件，具体说明如下：
- 序列文件（.gz格式）：
- pr2_version_5.1.0_SSU_taxo_long.fasta.gz：SSU核糖体RNA序列文件（长格式分类信息）
- pr2_version_5.1.0_SSU_mothur.fasta.gz：适用于Mothur软件的SSU序列文件
- pr2_version_5.1.0_SSU_mothur.tax.gz：适用于Mothur软件的分类信息文件
- pr2_version_5.1.0_SSU_UTAX.fasta.gz：适用于UTAX软件的SSU序列文件
- pr2_version_5.1.0_SSU_dada2.fasta.gz：适用于DADA2软件的SSU序列文件
- 压缩文件（.zip格式）：
- pr2_version_5.1.0_emu.zip：适用于EMU软件的数据包
- 表格文件（.xlsx格式）：
- pr2_version_5.1.0_merged.xlsx：合并后的数据集
- pr2_version_5.1.0_taxonomy.xlsx：分类学信息表
- pr2_version_5.1.0_chimera.xlsx：嵌合体序列信息表
- pr2_version_5.1.0_unassigned.xlsx：未分配序列信息表
- 训练模型文件（.rds格式）：
- pr2_version_5.1.0_SSU.decipher.trained.rds：Decipher软件的训练模型文件
适用场景
- 微生物分类学研究：用于核糖体RNA序列的分类鉴定
- 生物信息学分析：适配Mothur、DADA2、UTAX等主流序列分析软件
- 环境微生物多样性分析：提供标准化的参考序列数据库
- 分子生态学研究：支持基于SSU核糖体RNA的群落组成分析
