PRC_系统发育树多样化速率评估方法数据集

数据集概述

本数据集为论文“A parametric method for assessing diversification rate variation in phylogenetic trees”配套数据,包含用于评估系统发育树中多样化速率差异的PRC方法相关文件,可支持检测谱系间多样化速率变异、比较先验定义类群的速率差异,适用于生态与进化过程推断研究。

文件详解

  • 文件名称:README_for_PRC_archive.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含PRC_archive.zip文件的内容说明,解释各子文件的功能与用途。
  • 文件名称:PRC_archive.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含:
  • BenFunc.R:实现将一个phylo类树嫁接到另一个phylo类树的函数
  • moreTrees:分析模拟树的脚本
  • 以"trees"开头的文件:Phylogen(v1.1)模拟生成的树文件,命名包含树大小(分类单元数)、死亡速率(出生率设为1)等信息

数据来源

论文“A parametric method for assessing diversification rate variation in phylogenetic trees”

适用场景

  • 系统发育树多样化速率分析:使用PRC方法检测谱系间多样化速率变异,识别与树其余部分速率不一致的亚分支
  • 进化过程推断研究:通过多样化速率变异模式,推断支系发生的潜在生态与进化过程
  • 模拟树数据分析:利用模拟树文件验证PRC方法的假阳性率与统计功效
  • 生物类群速率比较:对先验定义的类群(非单系群亦可)进行多样化速率比较
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 12.62 MiB
最后更新 2026年2月2日
创建于 2026年2月2日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。