PREFFECT_Based_FFPE转录组学生成式建模合成数据集

数据集概述

本数据集包含论文“Generative and integrative modeling for transcriptomics with formalin fixed paraffin embedded material”中使用的全部合成数据,专为PREFFECT工具设计,用于分析福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的RNA测序数据,支持转录组学生成式建模研究。

文件详解

  • 文档文件
  • 文件名称:ReadMe.rtf
  • 文件格式:RTF
  • 字段映射介绍:包含数据集说明,如dataset_simple_1的分布(NB)、批次(2个)、批次平衡(50%)、基因数量等信息
  • 压缩文件
  • 文件名称:synthetic_preffect_datasets.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含用于PREFFECT工具的AnnData格式合成数据集,支持FFPE样本转录组学分析

数据来源

论文“Generative and integrative modeling for transcriptomics with formalin fixed paraffin embedded material”(BioRxiv)

适用场景

  • FFPE样本转录组学分析: 用于测试和验证PREFFECT工具对FFPE样本RNA测序数据的处理效果
  • 生成式建模研究: 支持转录组学生成式与整合建模方法的开发与评估
  • 生物信息学工具测试: 为PREFFECT等FFPE样本分析软件提供标准化测试数据
  • 转录组数据模拟研究: 基于合成数据探索FFPE样本转录组数据的特征与建模方法
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 810.44 MiB
最后更新 2026年1月27日
创建于 2026年1月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。