数据集概述
本数据集包含论文“Generative and integrative modeling for transcriptomics with formalin fixed paraffin embedded material”中使用的全部合成数据,专为PREFFECT工具设计,用于分析福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的RNA测序数据,支持转录组学生成式建模研究。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:ReadMe.rtf
- 文件格式:RTF
- 字段映射介绍:包含数据集说明,如dataset_simple_1的分布(NB)、批次(2个)、批次平衡(50%)、基因数量等信息
- 压缩文件
- 文件名称:synthetic_preffect_datasets.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于PREFFECT工具的AnnData格式合成数据集,支持FFPE样本转录组学分析
数据来源
论文“Generative and integrative modeling for transcriptomics with formalin fixed paraffin embedded material”(BioRxiv)
适用场景
- FFPE样本转录组学分析: 用于测试和验证PREFFECT工具对FFPE样本RNA测序数据的处理效果
- 生成式建模研究: 支持转录组学生成式与整合建模方法的开发与评估
- 生物信息学工具测试: 为PREFFECT等FFPE样本分析软件提供标准化测试数据
- 转录组数据模拟研究: 基于合成数据探索FFPE样本转录组数据的特征与建模方法