数据集概述
本数据集是Prentice等人2017年关于哺乳动物时钟基因选择信号研究的配套数据,聚焦含编码三核苷酸重复序列的时钟基因与气候变化快速适应的关联。数据涵盖22个时钟基因的重复序列特征,以及3组近缘物种(加拿大猞猁与红猞猁、南北飞鼠、白足鼠与鹿鼠)中NR1D1、CLOCK、PER1三个基因的选择信号分析结果,为气候变化适应性基因组学研究提供支撑。
文件详解
- 文件名称:
Prentice et al. 2017_DATA.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:作为研究配套数据文件,推测包含以下核心信息:22个哺乳动物时钟基因的三核苷酸重复序列特征数据;3组近缘物种对中3个目标时钟基因的基因型频率、等位基因分布数据;选择信号分析(如正选择、平衡选择、 disruptive选择)的统计结果;物种地理分布与气候适应性关联的相关标注信息。
数据来源
Prentice et al. 2017研究(标题:Signatures of selection in mammalian clock genes with coding trinucleotide repeats: implications for studying the genomics of high-pace adaptation)
适用场景
- 气候变化适应性基因组学研究:分析时钟基因三核苷酸重复序列在物种快速适应气候变中的作用机制。
- 哺乳动物时钟基因进化分析:探究NR1D1、CLOCK、PER1等时钟基因的选择压力与物种生态位分化的关联。
- 三核苷酸重复序列功能研究:验证编码区三核苷酸重复相较于单核苷酸多态性在适应性进化中的速率优势。
- 物种适应性策略比较:对比不同纬度分布近缘物种对的时钟基因选择信号差异,揭示气候适应的遗传基础。