数据集概述
本数据集为NCBI BioProject PRJNA966929的补充数据，包含塞舌尔 Amirante群岛野生黑鳍礁鲨（Carcharhinus melanopterus）体表、口腔/颊腔、泄殖腔及周围水体的细菌群落16S rRNA基因扩增子测序结果及功能预测数据，涵盖ASV序列计数、群落组成统计、指示类群分析、代谢功能预测等内容，共6个Excel文件。
文件详解
- 补充表S2：Supp. Table S2_ASVcounts.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含鲨鱼及海水样本的16S rRNA基因序列扩增子序列变体（ASV）计数、分类注释及代表性序列，已去除低丰度序列（所有样本中总序列数2.0）及加权最近测序分类单元指数（NSTI）评分
- 补充表S7：Supp. Table S7_Lefse_MetaCyc.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：基于细菌群落数据预测的海水及鲨鱼不同微环境代谢（MetaCyc）通路的LEfSe分析结果
数据来源
NCBI BioProject PRJNA966929
适用场景
- 海洋动物微生物组研究：分析黑鳍礁鲨不同微环境（体表、口腔、泄殖腔）与周围水体的细菌群落组成差异
- 微生物多样性分析：利用α/β多样性指数及统计检验结果，探究鲨鱼相关微环境对细菌多样性的影响
- 微生物功能预测：基于PICRUSt2结果研究鲨鱼微生物组的潜在代谢功能及生态作用
- 指示微生物筛选：通过指示类群分析和LEfSe分析，识别与鲨鱼特定微环境相关的标志性细菌类群
- 海洋生态系统微生物互作研究：比较鲨鱼微环境与水体细菌群落的关联性，探讨海洋生物-微生物-环境的相互作用
