PRKN_FCGR_灵长类基因进化关系分形分析补充数据

数据集概述

本数据集为PRKN基因灵长类进化关系分析的补充材料,包含核苷酸频率统计、分形图形、熵值计算及系统发育树等信息。通过频率混沌游戏法(FCGR)生成分形,结合核苷酸频率、香农熵和树状图,用于研究灵长类PRKN基因的进化关系,支持生物信息学和进化生物学分析。

文件详解

  • 压缩包文件:
  • 文件名称:Suplementary_Material_Fractals.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容结构:包含6类补充材料子目录,具体如下:
  • 01 Supplementary Material:含Excel文件(核苷酸频率数据)及2个子文件夹(核苷酸相对/总频率柱状图)
  • 02 Supplementary Material:含16个灵长类物种子文件夹,各含3-11 k-mer分形图像(共9张/物种)
  • 03 Supplementary Material:含3个子文件夹(7-mer频率与组成、7-mer分形图、3D景观分形图)
  • 04 Supplementary Material:含16个灵长类物种的7-mer CGR分形验证图像
  • 05 Supplementary Material:含香农熵柱状图(PNG)及熵值表(Excel)
  • 06 Supplementary Material:含2个7-mer树状图(带/不带外类群)

数据来源

论文“Frequency chaos game method and fractals show evolutionary relationships of the PRKN gene in primates”

适用场景

  • 灵长类PRKN基因进化分析: 利用核苷酸频率、分形特征和树状图研究基因序列的进化关系与亲缘性
  • 生物信息学分形方法验证: 评估FCGR和CGR算法在基因序列可视化与进化分析中的应用效果
  • 基因序列核苷酸特征研究: 分析不同灵长类物种PRKN基因的核苷酸组成及频率分布规律
  • 进化生物学数据可视化: 通过分形图形和3D景观展示基因序列的结构特征与物种差异
  • 系统发育树构建与验证: 利用7-mer数据构建的树状图,验证灵长类物种的分类与进化分支
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 157.0 MiB
最后更新 2026年1月31日
创建于 2026年1月31日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。