数据集概述
本数据集围绕无分支长度的概率发散时间估计方法,针对恐龙起源、鸟类飞行起源及冠群鸟类起源的时间展开研究。包含相关的时间估计结果、系统发育树、代码文件及数据文件等,用于支持古生物演化时间的分析,共14个文件。
文件详解
- 时间估计与数据文件
- 文件名称:cal3_dates.txt、dinosaur_timelist.txt、Hedman_dates.txt、dinosaur_occurrences.txt、dinosaur_tipages.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含恐龙年龄数据、时间列表、Hedman日期数据、恐龙出现记录、恐龙端点年龄等信息
- 系统发育树文件
- 文件名称:consensus.tre、dinosaur_dating_100_mpts.tre、dinosaur_tnt_1000_mpts.tre.zip、dinosaur_str_1000_mpts.tre.zip
- 文件格式:TRE、ZIP
- 字段映射介绍:包含共识树、100个最简约树的时间校准树、1000个最简约树的TNT文件压缩包等系统发育树数据
- 代码文件
- 文件名称:cal3_rates_code_11-11-16.R、cal3_dating_code.R、Hedman_code.r
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于cal3速率计算、cal3时间校准、Hedman方法的代码文件
- 其他文件
- 文件名称:dinosaur_occurrences.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:恐龙出现记录的表格数据
- 文件名称:dinosaur_MRP.tnt
- 文件格式:TNT
- 字段映射介绍:恐龙矩阵表示法的TNT文件
适用场景
- 古生物演化时间研究:分析恐龙、鸟类飞行及冠群鸟类的起源时间
- 系统发育树分析:基于提供的系统发育树文件开展相关演化关系研究
- 概率时间估计方法验证:验证无分支长度的概率发散时间估计方法的可行性
- 古生物数据整合分析:结合出现记录、端点年龄等数据开展综合研究
- 代码复用与方法复现:利用提供的R代码复现时间估计与校准过程