数据集概述
本数据集为Kashtan et al 2014年研究的补充数据，通过单细胞基因组学技术揭示野生原绿球藻中数百个共存亚群的基因组多样性。包含基因序列比对文件、映射表、复合基因组文件等，共9个文件，用于展示原绿球藻亚群的核心基因等位基因与柔性基因组合特征。
文件详解
- 序列比对文件（.fasta格式，共5个）
- 文件名称：WG_96_algn.fasta、Ecoli_WG_8_algn.fasta、COGS.fasta、ITS_96_algn.fasta、ITS_all_algn.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含原绿球藻及大肠杆菌的基因序列比对数据，用于分析基因组多样性与亚群特征
- 映射表文件（.xlsx格式，共2个）
- 文件名称：ITS_to_MDA_mapping_final.xlsx、ITS_to_MDA_96cells.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录ITS序列名称与MDA序列名称的映射关系，关联测序孔位信息
- 复合基因组文件
- 文件名称：C1_composite_genome.gbk
- 文件格式：GBK
- 字段映射介绍：包含原绿球藻复合基因组的结构化信息
- 说明文件
- 文件名称：README_for_COGS.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集的补充说明文档，解释各文件的背景与用途
数据来源
Kashtan et al 2014年研究“Single-cell genomics reveals hundreds of coexisting subpopulations in wild Prochlorococcus”
适用场景
- 微生物基因组多样性研究：分析野生原绿球藻亚群的核心基因与柔性基因组合特征
- 单细胞基因组学技术应用：验证单细胞测序技术在微生物亚群检测中的有效性
- 海洋微生物生态研究：探究原绿球藻亚群的生态位分化与共存机制
- 进化生物学分析：研究原绿球藻亚群的演化历史与基因变异规律
