数据集概述
该数据集包含与ProCogGraph数据库相关的多个压缩文件，涵盖数据库构建所需的扁平文件、配体与同源物对的相似性计算数据、结构域与结合实体的映射文件等，为ProCogGraph数据库的构建和相关分析提供支持。
文件详解
- 文件名称: alphacognate_data_files.zip，文件格式: ZIP。包含运行alphacognate流程所需的ProCogGraph数据文件，如配体/同源物对的相似性计算文件all_parity_calcs.pkl及描述符文件。
- 文件名称: procoggraph_flat_files_v1-0-2.zip，文件格式: ZIP。包含构建ProCogGraph数据库所需的所有扁平文件，更新了SCOP节点以包含正确的结构域组和描述信息。
- 文件名称: procoggraph_coglig_domain_mappings_v1-0.zip，文件格式: ZIP。包含CATH、SCOP、Pfam等结构域数据库的映射文件，将结构域与结合实体关联（结合实体需有一个以上同源配体，相似性阈值≥0.4 PARITY分数）。
- 文件名称: procoggraph_bound_entity_domain_mappings_v1-0.zip，文件格式: ZIP。包含CATH、SCOP、Pfam等结构域数据库的映射文件，将结构域与结合实体关联（不限制是否存在同源配体）。
适用场景
- 生物信息学研究: 用于ProCogGraph数据库的构建与探索。
- 蛋白质结构域分析: 研究结构域与结合实体、同源配体的关联模式。
- 配体-蛋白质相互作用研究: 基于相似性阈值分析同源配体与结构域的结合关系。
- 数据库开发与维护: 支持生物分子相关数据库的更新与完善。
