数据集概述
本数据集围绕北美东海岸浣熊种群对浣熊狂犬病毒(RRV)的局部适应展开,对比分析中性(微卫星位点)和功能性(主要组织相容性复合体MHC)遗传多样性的空间模式,探究种群暴露于RRV的时间(0-60年)与MHC等位基因频率的关联,揭示局部适应的遗传机制。
文件详解
- 文件名称:Kyle et al_genodata_RRV Spatial MHC.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含浣熊种群的中性微卫星位点遗传数据、MHC基因座(DRB外显子2)的功能遗传数据,以及种群暴露于RRV的时间、地理空间信息和感染RRV毒株类型等关联数据。
数据来源
论文“Spatial patterns of neutral and functional genetic variation reveal patterns of local adaptation in raccoon (Procyon lotor) populations exposed to raccoon rabies”
适用场景
- 野生动物种群遗传学研究:分析浣熊种群中性与功能性遗传多样性的空间结构及局部适应机制。
- 宿主-寄生虫协同进化研究:探究浣熊对狂犬病毒的免疫适应(MHC变异)与病毒暴露时间的关联。
- 景观流行病学分析:为预测狂犬病毒传播提供种群遗传适应性的空间数据支持。
- 遗传多样性与疾病抗性关联研究:验证MHC多样性与狂犬病毒易感性/抗性的潜在关系。