数据集概述
本数据集包含Project TIN CANN项目的基因标记聚类分析相关文件,涵盖聚类分析流程、基因标记筛选、可视化图表及实验记录,为生物基因聚类研究提供多类型数据支持。
文件详解
- 文件名称: 04_README_projMCS2(无扩展名):项目说明文档,介绍projMCS2.R(去重复、迭代LSI、Harmony整合、聚类及混淆矩阵生成)和projMCS2_scEmbeddings.R(UMAP/TSNE降维可视化)的分析流程
- 文件名称: 04_MCS2023_1-31-2024.pptx:PPT文件,可能包含项目背景、聚类分析结果演示等内容
- 文件名称: 04_GeneMarkers_byCluster_1-31-2024.xlsx:Excel表格,可能存储各聚类对应的基因标记数据
- 文件名称: 04_GeneMarkers_Top50_Heatmap_1-25-2024.pdf:PDF文件,展示前50个基因标记的热图可视化结果
- 文件名称: 04_Plot-Tracks-MarkerGenes_2024-04-04.pdf:PDF文件,呈现基因标记的轨迹图可视化内容
- 文件名称: 04_Cluster_Analysis_2024-02-12.xlsm:带宏的Excel文件,可能包含聚类分析的宏代码或交互式分析工具
适用场景
- 生物信息学研究:分析基因标记与细胞聚类的关联
- 基因表达分析:探索不同聚类中关键基因的表达特征
- 可视化方法应用:研究UMAP、TSNE等降维方法在基因聚类数据中的效果
- 聚类算法评估:基于混淆矩阵等结果评估聚类算法的性能