数据集概述
本数据集为Pronophila分支系统发育与分类学研究的配套数据，包含用于分析的分子序列比对、系统发育树、模型参数及时间校准分析文件等，支持解析原多系属Pseudomaniola的分类问题，共包含七个文件。
文件详解
- concatenated.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：研究中使用的488个基因座的串联比对文件，采用phylip格式
- individual.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：488个单独基因座的比对文件压缩包，采用fasta格式
- scheme.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：ModelFinder选择的分区和替换模型文件，采用nexus格式
- best_tree.nwk.tree
- 文件格式：TREE
- 字段映射介绍：最大似然分析得到的最优树文件，采用newick格式
- Pseudomaniola_BEAST.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST2中用于时间校准分析的输入文件，采用xml格式
- Pseudomaniola_BEAST_tree.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：BEAST分析得到的时间校准树文件，采用nexus格式
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集文件说明文档，包含各文件内容描述
数据来源
论文“Phylogeny and systematics of the 'Pronophila clade', with two new genera to resolve the formerly polyphyletic genus Pseudomaniola (Lepidoptera: Nymphalidae, Satyrinae)”
适用场景
- 蝴蝶分类学研究：用于解析Pronophila分支的系统发育关系，支持新属的分类修订
- 分子系统发育分析：利用串联比对数据进行蝴蝶分支的系统发育树构建与验证
- 进化时间校准研究：通过BEAST输入文件与结果树分析Pronophila分支的分化时间
- 模型参数验证：基于ModelFinder选择的分区和替换模型，开展系统发育模型优化研究
