数据集概述
本数据集为Burmann等人关于MukBEF加载机制研究的蛋白组学原始数据,对应论文中的图3和图S3。包含14个文件,涵盖TMT蛋白质组学实验的原始分析结果、蛋白质组信息、肽段信息、丰度数据摘要等,用于支持MukBEF DNA捕获状态及病毒DNA模拟物干扰机制的研究。
文件详解
- 说明文件
- 文件名称:README_ZENODO.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集的描述信息,说明该Zenodo条目包含Protein Discoverer 2.1分析TMT-pulldown实验的原始和摘要数据,涉及8个样本的相对蛋白丰度分析,用于FLAG T7 gp5.9 pulldown实验。
- 原始分析结果文件
- 文件名称:Bryony Clifton 081221 8Plex TMT_MSMSSpectrumInfo.txt、Bryony Clifton 081221 8Plex TMT_ProteinGroups.txt、Bryony Clifton 081221 8Plex TMT_PeptideGroups.txt、Bryony Clifton 081221 8Plex TMT_ResultStatistics.txt、Bryony Clifton 081221 8Plex TMT_Proteins.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含蛋白质组学实验的原始分析结果,如蛋白质组ID、肽段信息、结果统计等。
- 数据摘要文件
- 文件名称:TMT_abundance_data_summary.xlsx、Bryony Clifton 081221 8Plex TMT.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含TMT丰度数据的摘要信息,用于展示实验样本的相对蛋白丰度结果。
- 其他分析结果文件
- 文件名称:Bryony Clifton 081221 8Plex TMT.pdResultView、Bryony Clifton 081221 8Plex TMT_PS.msfView、Bryony Clifton 081221 8Plex TMT.pdStudy、Bryony Clifton 081221 8Plex TMT.pdStudy.bak
- 文件格式:pdResultView、msfView、pdStudy、bak
- 字段映射介绍:Protein Discoverer软件的分析结果文件,包含实验的研究项目信息、结果视图等。
数据来源
Burmann et al "Loading of MukBEF involves a DNA capture state and is disrupted by a viral DNA mimic"
适用场景
- 蛋白质组学研究:用于分析MukBEF相关的蛋白质组信息,支持蛋白质组学实验的数据分析。
- 分子生物学研究:研究MukBEF的DNA捕获状态及病毒DNA模拟物对其的干扰机制。
- 生物信息学分析:利用蛋白质组学数据进行生物信息学分析,如蛋白质丰度分析、肽段鉴定等。
- 学术研究支持:为相关领域的学术研究提供原始的蛋白组学数据,支持进一步的实验验证和机制探讨。