数据集概述
本数据集为亚马逊热带树种Protium subserratum(橄榄科)在不同土壤类型(白砂、棕砂、粘土)中的生态分化研究数据,包含遗传微卫星数据、形态学数据、种群定位数据及分析输入文件,旨在探究土壤异质性对热带树种遗传变异和多样性维持的作用,共8个文件。
文件详解
- 形态学数据集文件
- 文件名称:
Morphology_dataset.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含叶片形态测量数据,如叶片总长度(Leaf1length)、小叶数量(Leaf1_leaflet)、小叶长度(leaflet_1length)等形态特征字段
- 文件名称:
README_for_Morphology_dataset.rtf
- 文件格式:RTF
- 字段映射介绍:形态学数据集的说明文档,定义各形态学指标的测量标准(如叶片长度为叶柄基部到顶小叶尖端的总长度)
- 遗传数据文件
- 文件名称:
Raw_msat_genealexinput.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:核微卫星原始数据,适用于GeneAlex软件分析的输入格式
- 文件名称:
Structureinput.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:种群遗传结构分析软件Structure的输入文件
- 文件名称:
Migrate-N input file.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:种群迁移率分析软件Migrate-N的输入文件,包含13个种群的遗传数据
- 文件名称:
BS-B_ClayB_newhybridinput.txt、BS-A_WS-A_newhybridinput.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:杂交分析软件NewHybrid的输入文件,分别对应棕砂-粘土种群、棕砂-白砂种群的杂交检测数据
- 定位数据文件
- 文件名称:
locality data for final data set.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:种群采样地点的定位信息数据
数据来源
论文“Evidence for ecological divergence across a mosaic of soil types in an Amazonian tropical tree: Protium subserratum (Burseraceae)”
适用场景
- 热带植物生态分化研究:分析Protium subserratum在不同土壤类型中的形态与遗传分化特征
- 土壤异质性与物种多样性维持机制研究:探究亚马逊雨林土壤马赛克分布对树种遗传变异的驱动作用
- 种群遗传学分析:利用微卫星数据开展种群结构、迁移率及杂交检测的验证研究
- 植物形态-遗传关联分析:结合形态学与遗传数据,研究表型变异与遗传分化的相关性
- 亚马逊生物多样性维持机制研究:为热带森林树种多样性的起源与维持提供土壤驱动的实证数据支持