数据集概述
本数据集为果蝇(Drosophila melanogaster)对雷氏普罗威登斯菌(Providencia rettgeri)感染的抗性与耐受性遗传架构研究数据,包含基因组关联分析结果、感染后适合度与感染强度的回归残差数据,以及30个耐受相关基因座信息,用于探究宿主防御策略的遗传基础及抗性与耐受性的关联。
文件详解
- TXT文件(共7个)
- 文件名称:allunbaisedact_load_20150212.txt、Mean_values_adjusted_unadjusted_20161207.txt、extsurvallrepswithsum_20150609.txt、c564pinload3reps_20150616.txt、extloadallreps_20150608.txt、alldgrploaddata3.24.14.txt、allrepspinsurvc564_20150627.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含果蝇品系名称、文库信息、感染强度相关指标(如cfuperml、cfuper3flies)、对数转换值(lncfuper3flies)、重复次数(rep)、实验区块(block)、性状类型(trait)等感染抗性与耐受性的原始及处理后数据。
- XLSX文件(1个)
- 文件名称:CompleteSurvivalActin5C_20150219.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Actin5C品系果蝇感染后的生存数据,记录不同时间点的存活情况及相关统计值。
- XLS文件(1个)
- 文件名称:ALLsurvivaldata4.5.14.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含所有品系果蝇感染后的生存数据汇总,记录感染后的存活时间、存活状态等信息。
数据来源
论文“The genetic architecture of defence as resistance to and tolerance of bacterial infection in Drosophila melanogaster”
适用场景
- 免疫遗传学研究:分析果蝇对细菌感染的抗性与耐受性的遗传变异及相关基因功能。
- 宿主-病原体互作机制研究:探究抗性与耐受性的关联及共同进化关系。
- 医学转化研究:为开发以改善宿主健康为目标的感染治疗策略提供理论参考。
- 基因功能验证:通过RNAi实验验证grainy head、debris buster等基因在免疫防御中的作用。