数据集概述
本数据集包含假单胞菌属菌株Pseudomonas sp. KK18的基因组注释相关文件,涵盖抗生物合成基因簇、原核生物基因组注释、快速注释子系统技术及功能注释等不同类型的注释结果,总计4个文件,支持微生物基因组功能分析与基因挖掘研究。
文件详解
- 抗生物合成基因簇注释文件
- 文件名称:Pseudomonas sp. KK18_antiSMASH.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含使用antiSMASH工具对Pseudomonas sp. KK18基因组进行抗生物合成基因簇预测的注释结果
- 原核生物基因组注释文件
- 文件名称:Pseudomonas sp. KK18_Prokka.fasta.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含使用Prokka工具生成的Pseudomonas sp. KK18基因组注释的FASTA格式文件
- 快速注释子系统技术注释文件
- 文件名称:Pseudomonas sp. KK18_RAST.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含使用RAST工具对Pseudomonas sp. KK18基因组进行功能注释的结果文件
- 功能注释映射文件
- 文件名称:Pseudomonas sp. KK18_eggnog-mapper.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含使用eggnog-mapper工具对Pseudomonas sp. KK18基因组进行功能注释的映射结果
适用场景
- 微生物基因组功能注释分析: 用于解析Pseudomonas sp. KK18的基因功能、代谢通路及潜在生物合成能力
- 抗生物合成基因簇挖掘: 通过antiSMASH注释结果识别菌株中的次级代谢产物合成基因簇
- 微生物基因组注释工具对比研究: 比较不同注释工具(Prokka、RAST、eggnog-mapper)对同一菌株的注释差异
- 微生物资源开发研究: 基于注释信息挖掘Pseudomonas sp. KK18的潜在应用价值(如生物防治、代谢产物生产等)