Pseudomonas_sp_KK18_基因组注释文件数据集

数据集概述

本数据集包含假单胞菌属菌株Pseudomonas sp. KK18的基因组注释相关文件,涵盖抗生物合成基因簇、原核生物基因组注释、快速注释子系统技术及功能注释等不同类型的注释结果,总计4个文件,支持微生物基因组功能分析与基因挖掘研究。

文件详解

  • 抗生物合成基因簇注释文件
  • 文件名称:Pseudomonas sp. KK18_antiSMASH.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含使用antiSMASH工具对Pseudomonas sp. KK18基因组进行抗生物合成基因簇预测的注释结果
  • 原核生物基因组注释文件
  • 文件名称:Pseudomonas sp. KK18_Prokka.fasta.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含使用Prokka工具生成的Pseudomonas sp. KK18基因组注释的FASTA格式文件
  • 快速注释子系统技术注释文件
  • 文件名称:Pseudomonas sp. KK18_RAST.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含使用RAST工具对Pseudomonas sp. KK18基因组进行功能注释的结果文件
  • 功能注释映射文件
  • 文件名称:Pseudomonas sp. KK18_eggnog-mapper.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含使用eggnog-mapper工具对Pseudomonas sp. KK18基因组进行功能注释的映射结果

适用场景

  • 微生物基因组功能注释分析: 用于解析Pseudomonas sp. KK18的基因功能、代谢通路及潜在生物合成能力
  • 抗生物合成基因簇挖掘: 通过antiSMASH注释结果识别菌株中的次级代谢产物合成基因簇
  • 微生物基因组注释工具对比研究: 比较不同注释工具(Prokka、RAST、eggnog-mapper)对同一菌株的注释差异
  • 微生物资源开发研究: 基于注释信息挖掘Pseudomonas sp. KK18的潜在应用价值(如生物防治、代谢产物生产等)
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数据与资源

该数据集没有数据

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.0 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。