数据集概述
本数据集围绕伪切叶蚁属（Pseudomyrmex）豆科植物共生蚂蚁的细菌群落展开研究，通过稳定同位素分析明确其低营养级食性，结合细菌群落结构比较（含同位素数据、OTU表、基因组组装等），探究营养级差异对共生菌的影响，重点关注潜在营养功能菌（如含氮循环通路的 Bartonella 相关类群）。
文件详解
- 基因组与序列文件
- 文件名称：TPNIG.tar.gz、FPNIG.tar.gz、BER0554_assembly.fa.gz、BER0517_assembly.fa.gz、zotu_rep_seqs.fa.gz、contaminant_free.fa.gz
- 文件格式：.tar.gz、.fa.gz
- 字段映射介绍：包含蚂蚁共生菌的基因组组装序列、代表性操作分类单元（OTU/ZOTU）序列及去污染后的序列文件，用于微生物分类和功能分析
- 群落与同位素数据文件
- 文件名称：OTU_table.tsv
- 文件格式：.tsv
- 字段映射介绍：记录不同样本（如CSM2329.1、MEW0128.1等）中细菌OTU的相对丰度，用于群落结构比较
- 文件名称：nitrogen_isotopes.xlsx
- 文件格式：.xlsx
- 字段映射介绍：包含蚂蚁稳定同位素分析数据，反映其营养级位置
数据来源
论文“Dietary specialization in mutualistic acacia-ants affects relative abundance but not identity of host-associated bacteria”
适用场景
- 昆虫共生微生物研究：分析伪切叶蚁属共生细菌的群落组成、丰度差异及潜在功能
- 营养生态学研究：结合稳定同位素数据，探究营养级对生物共生菌结构的影响机制
- 微生物功能基因组学：通过基因组组装数据挖掘共生菌的营养代谢通路（如氮循环）
- 生物共生系统演化分析：研究豆科植物-蚂蚁共生关系中微生物的协同演化角色
